医疗流程管理硕士课程（全日制，120 ECTS）面向拥有第一大学学位的学生。学制为三个学期加上完成硕士论文所需的时间。该课程传授医学知识、医疗系统知识、医疗IT以及质量和流程管理技能。目标是提高患者利益和医疗行业的附加值。只有FAU提供此类课程。课程在冬季学期开始。

第一学期：模块1.1：医学基础；模块1.2：医疗管理I；模块1.3：疾病检测基础；模块1.4：第一和第二学期之间的实习。第二学期：模块2.1：临床医学导论；模块2.2：医疗管理II；模块2.3：医疗系统中的IT支持流程；模块2.4：医疗业务流程管理；模块2.5：第二和第三学期之间的实习。第三学期：模块3.1：成像技术、放射治疗和辐射防护；模块3.2：医疗管理III；模块3.3：从临床流程到治疗路径；模块3.5：第三和第四学期之间的实习；模块3.6（附加模块）*：医院管理I；模块3.7（附加模块）*：门诊管理I；模块3.8：制药管理I；模块3.9：成本单位I。第四学期：模块4.1：硕士考试：硕士论文和口试。

第一大学学位（本科），需通过资格评估

毕业生可在诊所、健康保险公司、卫生经济学和IT领域以及制药和医疗器械行业或医疗设施的建设和运营中工作。具体职业领域包括：基于需求的医疗和保险系统：医院、医疗实践、实验室和医疗网络中的流程管理；健康保险公司的病例管理。卫生经济学或卫生系统研究：法定健康保险的服务目录；医疗保健提供者的投资组合管理。医疗咨询：战略咨询、组织咨询。